V měsíci listopadu roku 1998 bylo započato s přípravou obnovení Řádu Křižovníků s červeným srdcem. Bylo rozhodnuto, že původně řeholní Řád bude obnoven jako ekumenický otevřený všem lidem jenž chtějí pomáhat druhým. Dne 16. března roku 1999 Ministerstvo vnitra Řád schválilo jako občanské sdružení.
Dne 23. dubna roku 2011 se v Praze na Vyšehradě konalo setkání řádových členů na kterém bylo rozhodnuto o tom, že Řád bude mít své Řádové velkopřevorství v Praze. Dále byla projednána nová koncepce a struktura Řádu.
V červnu téhož roku byla podána žádost na Ministerstvo vnitra České republiky o změnu názvu Řádu a jeho statutu. Bylo požádáno o registraci podle ustanovení § 3 odst. 1 písm. a) zákona č. 116/1985 Sb., o podmínkách činnosti organizací s mezinárodním prvkem v ČSR. Ministerstvo vnitra České republiky této žádosti vyhovělo a dne 30. prosince roku 2011 udělilo Řádu statut Mezinárodní nevládní organizace.
Zároveň v tomto roce zaniklo občanské sdružení Křižovníci s červeným srdcem a jeho členové vstoupili do nové organizace Mezinárodního řádu Křižovníci s červeným srdcem – Cyriaci.
Mezinárodní řád Křižovníci s červeným srdcem, mezinárodní nevládní organizace, se považuje za přímé nástupce a pokračovatele originálního řádu Křižovníků s červeným srdcem, který má staleté tradice jako řád špitálnický.
11 května 2018 byla provedená změna názvu Mezinárodní řád Křižovníků s červeným srdcem, společenství Svatého Cyriaka.
V období 01. 01. 2014 až 04. 01. 2019 byl Generálním převorem Bc. Jiří Stanislav
V období 04. 01. 2019 až doposud je Generálním převorem Petr Enc
